在中国科技论文与引文数据库中，1999年度影响因子达到0.746,被引频次162；2001年影响因子达到0.843，被引频次310，位居前列；2004年影响因子达到0.855，在计算机类期刊中排名第3。在中国学术期刊综合引证报告中，2001～2003年影响因子达到0.7492,被引频次495；2004年影响因子达到0.8395，被引频次722，在计算机（应用）类期刊中名列第3；2005年度影响因子达到1.084，成为该领域首次突破1的期刊，遥遥领先于第2名。

    根据中国科技信息研究所2011年版《中国期刊引证报告》，《计算机集成制造系统》期刊2010年的总被引频次为2466，影响因子为1.081，他引率为0.83。